Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D2O95562 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D2O95562 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D2O95562 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D2O95562 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D2O95562 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D2O95562 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D2O95562 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D2O95562 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D2O95562 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D2O95562 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D2O95562 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D2O95562 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D2O95562 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D2O95562 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D2O95562 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D2O95562 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms