Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF1O95521 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF1O95521 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF1O95521 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF1O95521 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms