Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGR4O95473 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGR4O95473 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms