Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB6O95452 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB6O95452 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB6O95452 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB6O95452 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB6O95452 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB6O95452 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB6O95452 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB6O95452 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB6O95452 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB6O95452 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB6O95452 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB6O95452 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB6O95452 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB6O95452 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB6O95452 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB6O95452 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB6O95452 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB6O95452 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB6O95452 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB6O95452 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB6O95452 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB6O95452 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB6O95452 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB6O95452 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB6O95452 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB6O95452 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB6O95452 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB6O95452 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB6O95452 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJB6O95452 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB6O95452 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB6O95452 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB6O95452 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB6O95452 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB6O95452 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB6O95452 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB6O95452 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB6O95452 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB6O95452 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB6O95452 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB6O95452 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB6O95452 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB6O95452 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB6O95452 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB6O95452 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB6O95452 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB6O95452 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB6O95452 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJB6O95452 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJB6O95452 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB6O95452 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB6O95452 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB6O95452 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB6O95452 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB6O95452 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB6O95452 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB6O95452 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB6O95452 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB6O95452 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB6O95452 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB6O95452 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB6O95452 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB6O95452 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB6O95452 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB6O95452 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB6O95452 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB6O95452 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB6O95452 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB6O95452 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB6O95452 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB6O95452 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB6O95452 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB6O95452 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB6O95452 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB6O95452 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB6O95452 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB6O95452 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB6O95452 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB6O95452 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB6O95452 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB6O95452 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB6O95452 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB6O95452 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB6O95452 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB6O95452 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB6O95452 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB6O95452 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB6O95452 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB6O95452 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB6O95452 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB6O95452 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB6O95452 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB6O95452 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB6O95452 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB6O95452 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB6O95452 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GJB6O95452 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB6O95452 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB6O95452 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms