Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SLIT2O94813 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SLIT2O94813 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SLIT2O94813 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SLIT2O94813 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SLIT2O94813 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms