Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFPL2O75678 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFPL2O75678 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFPL2O75678 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RFPL2O75678 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms