Protein–RNA interactions for Protein: O75460

ERN1, Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERN1O75460 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERN1O75460 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERN1O75460 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERN1O75460 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERN1O75460 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERN1O75460 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERN1O75460 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERN1O75460 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERN1O75460 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERN1O75460 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERN1O75460 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERN1O75460 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERN1O75460 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERN1O75460 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERN1O75460 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERN1O75460 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERN1O75460 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERN1O75460 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERN1O75460 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERN1O75460 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERN1O75460 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERN1O75460 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERN1O75460 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERN1O75460 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERN1O75460 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERN1O75460 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERN1O75460 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERN1O75460 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERN1O75460 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERN1O75460 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERN1O75460 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERN1O75460 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERN1O75460 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ERN1O75460 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERN1O75460 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERN1O75460 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERN1O75460 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERN1O75460 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERN1O75460 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERN1O75460 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERN1O75460 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERN1O75460 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERN1O75460 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERN1O75460 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERN1O75460 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERN1O75460 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERN1O75460 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERN1O75460 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERN1O75460 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERN1O75460 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERN1O75460 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERN1O75460 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERN1O75460 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERN1O75460 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERN1O75460 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERN1O75460 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERN1O75460 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERN1O75460 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERN1O75460 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERN1O75460 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERN1O75460 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERN1O75460 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERN1O75460 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERN1O75460 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERN1O75460 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERN1O75460 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERN1O75460 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERN1O75460 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERN1O75460 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERN1O75460 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERN1O75460 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERN1O75460 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERN1O75460 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERN1O75460 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERN1O75460 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERN1O75460 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERN1O75460 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERN1O75460 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERN1O75460 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERN1O75460 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERN1O75460 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERN1O75460 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERN1O75460 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERN1O75460 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERN1O75460 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERN1O75460 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERN1O75460 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERN1O75460 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERN1O75460 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERN1O75460 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERN1O75460 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERN1O75460 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERN1O75460 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERN1O75460 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERN1O75460 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERN1O75460 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERN1O75460 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERN1O75460 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERN1O75460 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERN1O75460 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms