Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG13O75143 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG13O75143 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG13O75143 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG13O75143 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG13O75143 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG13O75143 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG13O75143 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG13O75143 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG13O75143 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG13O75143 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG13O75143 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG13O75143 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG13O75143 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG13O75143 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG13O75143 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG13O75143 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG13O75143 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG13O75143 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG13O75143 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG13O75143 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG13O75143 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG13O75143 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG13O75143 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG13O75143 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG13O75143 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG13O75143 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG13O75143 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG13O75143 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG13O75143 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG13O75143 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG13O75143 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG13O75143 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG13O75143 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG13O75143 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG13O75143 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG13O75143 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG13O75143 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG13O75143 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG13O75143 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG13O75143 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG13O75143 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG13O75143 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG13O75143 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATG13O75143 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG13O75143 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG13O75143 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG13O75143 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG13O75143 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG13O75143 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG13O75143 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG13O75143 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG13O75143 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG13O75143 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG13O75143 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG13O75143 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG13O75143 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG13O75143 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG13O75143 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG13O75143 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG13O75143 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG13O75143 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG13O75143 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG13O75143 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG13O75143 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG13O75143 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG13O75143 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG13O75143 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG13O75143 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG13O75143 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG13O75143 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG13O75143 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG13O75143 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG13O75143 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG13O75143 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG13O75143 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG13O75143 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG13O75143 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG13O75143 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG13O75143 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG13O75143 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG13O75143 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG13O75143 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG13O75143 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG13O75143 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG13O75143 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG13O75143 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG13O75143 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG13O75143 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG13O75143 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG13O75143 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG13O75143 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG13O75143 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG13O75143 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG13O75143 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG13O75143 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG13O75143 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG13O75143 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG13O75143 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG13O75143 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms