Protein–RNA interactions for Protein: O60684

KPNA6, Importin subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA6O60684 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KPNA6O60684 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KPNA6O60684 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KPNA6O60684 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KPNA6O60684 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KPNA6O60684 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KPNA6O60684 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KPNA6O60684 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KPNA6O60684 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KPNA6O60684 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KPNA6O60684 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KPNA6O60684 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KPNA6O60684 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KPNA6O60684 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KPNA6O60684 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KPNA6O60684 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KPNA6O60684 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KPNA6O60684 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 954.8 ms