Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MSCO60682 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MSCO60682 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MSCO60682 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSCO60682 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSCO60682 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSCO60682 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSCO60682 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MSCO60682 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSCO60682 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSCO60682 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSCO60682 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSCO60682 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSCO60682 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSCO60682 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MSCO60682 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSCO60682 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSCO60682 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSCO60682 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSCO60682 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSCO60682 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSCO60682 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSCO60682 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSCO60682 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSCO60682 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSCO60682 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSCO60682 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSCO60682 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSCO60682 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSCO60682 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSCO60682 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSCO60682 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSCO60682 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSCO60682 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSCO60682 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSCO60682 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSCO60682 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSCO60682 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSCO60682 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSCO60682 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSCO60682 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSCO60682 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSCO60682 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSCO60682 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSCO60682 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSCO60682 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSCO60682 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSCO60682 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSCO60682 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSCO60682 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSCO60682 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSCO60682 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSCO60682 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSCO60682 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSCO60682 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MSCO60682 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSCO60682 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSCO60682 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSCO60682 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSCO60682 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MSCO60682 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MSCO60682 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSCO60682 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSCO60682 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSCO60682 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSCO60682 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSCO60682 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MSCO60682 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSCO60682 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MSCO60682 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSCO60682 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MSCO60682 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSCO60682 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSCO60682 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSCO60682 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSCO60682 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSCO60682 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSCO60682 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSCO60682 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSCO60682 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSCO60682 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSCO60682 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSCO60682 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MSCO60682 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSCO60682 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MSCO60682 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSCO60682 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSCO60682 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSCO60682 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSCO60682 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSCO60682 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MSCO60682 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSCO60682 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MSCO60682 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MSCO60682 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MSCO60682 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MSCO60682 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MSCO60682 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MSCO60682 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MSCO60682 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.9 ms