Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD6O60522 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD6O60522 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD6O60522 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD6O60522 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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