Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3BO43837 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3BO43837 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3BO43837 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms