Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CBFA2T2O43439 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CBFA2T2O43439 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBFA2T2O43439 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CBFA2T2O43439 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CBFA2T2O43439 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms