Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1E1O43324 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EEF1E1O43324 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1E1O43324 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EEF1E1O43324 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms