Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC7A4O43246 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC7A4O43246 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC7A4O43246 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC7A4O43246 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC7A4O43246 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms