Protein–RNA interactions for Protein: O15258

RER1, Protein RER1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RER1O15258 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RER1O15258 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RER1O15258 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RER1O15258 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RER1O15258 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RER1O15258 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RER1O15258 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RER1O15258 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RER1O15258 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RER1O15258 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RER1O15258 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RER1O15258 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RER1O15258 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RER1O15258 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RER1O15258 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RER1O15258 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RER1O15258 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RER1O15258 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RER1O15258 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RER1O15258 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RER1O15258 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RER1O15258 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RER1O15258 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RER1O15258 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RER1O15258 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RER1O15258 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RER1O15258 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RER1O15258 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RER1O15258 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RER1O15258 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RER1O15258 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RER1O15258 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RER1O15258 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RER1O15258 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RER1O15258 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RER1O15258 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RER1O15258 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RER1O15258 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RER1O15258 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RER1O15258 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RER1O15258 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RER1O15258 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RER1O15258 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RER1O15258 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RER1O15258 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RER1O15258 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RER1O15258 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RER1O15258 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RER1O15258 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RER1O15258 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RER1O15258 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RER1O15258 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RER1O15258 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RER1O15258 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RER1O15258 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RER1O15258 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RER1O15258 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RER1O15258 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RER1O15258 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RER1O15258 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RER1O15258 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RER1O15258 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RER1O15258 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RER1O15258 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RER1O15258 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RER1O15258 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RER1O15258 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RER1O15258 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RER1O15258 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RER1O15258 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RER1O15258 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RER1O15258 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RER1O15258 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RER1O15258 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RER1O15258 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RER1O15258 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RER1O15258 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RER1O15258 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RER1O15258 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RER1O15258 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RER1O15258 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RER1O15258 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RER1O15258 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RER1O15258 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RER1O15258 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RER1O15258 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RER1O15258 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RER1O15258 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RER1O15258 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RER1O15258 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms