Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A1O15245 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC22A1O15245 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A1O15245 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms