Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB6O15197 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB6O15197 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB6O15197 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPHB6O15197 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB6O15197 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB6O15197 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB6O15197 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EPHB6O15197 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms