Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SYNMO15061 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNMO15061 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNMO15061 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNMO15061 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNMO15061 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNMO15061 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNMO15061 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNMO15061 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNMO15061 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNMO15061 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNMO15061 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNMO15061 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNMO15061 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNMO15061 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNMO15061 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNMO15061 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SYNMO15061 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SYNMO15061 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SYNMO15061 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SYNMO15061 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNMO15061 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SYNMO15061 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNMO15061 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNMO15061 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNMO15061 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNMO15061 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNMO15061 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNMO15061 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNMO15061 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNMO15061 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNMO15061 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNMO15061 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNMO15061 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNMO15061 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNMO15061 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNMO15061 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNMO15061 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNMO15061 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SYNMO15061 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SYNMO15061 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SYNMO15061 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SYNMO15061 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SYNMO15061 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SYNMO15061 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SYNMO15061 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SYNMO15061 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SYNMO15061 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SYNMO15061 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SYNMO15061 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SYNMO15061 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SYNMO15061 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYNMO15061 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYNMO15061 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYNMO15061 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
SYNMO15061 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SYNMO15061 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SYNMO15061 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SYNMO15061 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SYNMO15061 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
SYNMO15061 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
SYNMO15061 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SYNMO15061 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SYNMO15061 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SYNMO15061 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
SYNMO15061 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SYNMO15061 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
SYNMO15061 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SYNMO15061 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SYNMO15061 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SYNMO15061 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SYNMO15061 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SYNMO15061 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNMO15061 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNMO15061 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNMO15061 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNMO15061 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SYNMO15061 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SYNMO15061 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SYNMO15061 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYNMO15061 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYNMO15061 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
SYNMO15061 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYNMO15061 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNMO15061 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNMO15061 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNMO15061 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYNMO15061 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYNMO15061 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYNMO15061 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNMO15061 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNMO15061 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNMO15061 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNMO15061 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
SYNMO15061 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYNMO15061 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYNMO15061 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
SYNMO15061 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SYNMO15061 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
SYNMO15061 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms