Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
UBE2CO00762 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2CO00762 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2CO00762 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2CO00762 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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