Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3B1O00203 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B1O00203 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP3B1O00203 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms