Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QRK9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QRK9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QRK9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QRK9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QRK9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRK9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRK9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRK9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRK9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRK9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRK9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRK9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRK9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRK9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRK9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRK9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRK9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QRK9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QRK9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QRK9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QRK9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QRK9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QRK9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3QRK9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3QRK9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3QRK9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRK9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRK9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRK9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRK9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRK9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRK9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QRK9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QRK9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QRK9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QRK9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QRK9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QRK9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QRK9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QRK9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QRK9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QRK9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
J3QRK9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QRK9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QRK9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QRK9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QRK9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QRK9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QRK9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QRK9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QRK9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QRK9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QRK9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QRK9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QRK9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QRK9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QRK9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QRK9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QRK9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QRK9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QRK9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QRK9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QRK9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
J3QRK9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3QRK9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3QRK9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3QRK9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QRK9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QRK9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QRK9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QRK9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QRK9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QRK9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QRK9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QRK9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QRK9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QRK9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QRK9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QRK9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QRK9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QRK9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QRK9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QRK9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QRK9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QRK9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QRK9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QRK9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QRK9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QRK9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms