Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QQQ9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QQQ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QQQ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QQQ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QQQ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QQQ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QQQ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QQQ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QQQ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QQQ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QQQ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QQQ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QQQ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QQQ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QQQ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QQQ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3QQQ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3QQQ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3QQQ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3QQQ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3QQQ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3QQQ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3QQQ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QQQ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QQQ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QQQ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QQQ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QQQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QQQ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QQQ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QQQ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QQQ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3QQQ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3QQQ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3QQQ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3QQQ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3QQQ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3QQQ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3QQQ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3QQQ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3QQQ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QQQ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QQQ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QQQ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QQQ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QQQ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QQQ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QQQ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QQQ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QQQ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QQQ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QQQ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QQQ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QQQ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QQQ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QQQ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QQQ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QQQ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QQQ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QQQ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QQQ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QQQ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QQQ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QQQ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3QQQ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3QQQ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3QQQ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QQQ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QQQ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QQQ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QQQ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QQQ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QQQ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QQQ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3QQQ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3QQQ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3QQQ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3QQQ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3QQQ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3QQQ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3QQQ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3QQQ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3QQQ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3QQQ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QQQ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QQQ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QQQ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QQQ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QQQ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QQQ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3QQQ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3QQQ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3QQQ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3QQQ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
J3QQQ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QQQ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QQQ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QQQ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QQQ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms