Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2LH3BP13 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LH3BP13 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms