Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms