Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227AF5H4B4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM227AF5H4B4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms