Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB8E9PQR5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPIPB8E9PQR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB8E9PQR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms