Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN3E7EW58 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN3E7EW58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN3E7EW58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3E7EW58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3E7EW58 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN3E7EW58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3E7EW58 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3E7EW58 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3E7EW58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3E7EW58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3E7EW58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms