Protein–RNA interactions for Protein: C9JR72

KBTBD13, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD13C9JR72 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KBTBD13C9JR72 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KBTBD13C9JR72 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KBTBD13C9JR72 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KBTBD13C9JR72 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KBTBD13C9JR72 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KBTBD13C9JR72 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KBTBD13C9JR72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
KBTBD13C9JR72 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KBTBD13C9JR72 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms