Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRM5B3KS81 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM5B3KS81 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRRM5B3KS81 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms