Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM25AB3EWG3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM25AB3EWG3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms