Protein–RNA interactions for Protein: B2RUY7

VWC2L, von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2LB2RUY7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWC2LB2RUY7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWC2LB2RUY7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWC2LB2RUY7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms