Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SMTNL1A8MU46 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMTNL1A8MU46 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMTNL1A8MU46 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMTNL1A8MU46 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms