Protein–RNA interactions for Protein: A6NM36

LRRC30, Leucine-rich repeat-containing protein 30, humanhuman

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC30A6NM36 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC30A6NM36 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC30A6NM36 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC30A6NM36 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC30A6NM36 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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