Protein–RNA interactions for Protein: A6NM11

LRRC37A2, Leucine-rich repeat-containing protein 37A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC37A2A6NM11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC37A2A6NM11 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC37A2A6NM11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC37A2A6NM11 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC37A2A6NM11 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC37A2A6NM11 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC37A2A6NM11 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRC37A2A6NM11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms