Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM149AA5PLN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM149AA5PLN7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM149AA5PLN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM149AA5PLN7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM149AA5PLN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM149AA5PLN7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM149AA5PLN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM149AA5PLN7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM149AA5PLN7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM149AA5PLN7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms