Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5LA4QPB2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP5LA4QPB2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRP5LA4QPB2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP5LA4QPB2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms