Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POTEB3A0JP26 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
POTEB3A0JP26 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POTEB3A0JP26 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POTEB3A0JP26 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POTEB3A0JP26 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms