Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPK0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPK0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms