Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00854A0A1B0GVQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms