Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-5A0A0J9YX44 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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