Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFLP07196 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEFLP07196 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEFLP07196 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEFLP07196 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEFLP07196 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEFLP07196 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFLP07196 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms