Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
U3KQ87 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
U3KQ87 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQ87 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQ87 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQ87 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQ87 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQ87 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQ87 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQ87 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQ87 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQ87 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQ87 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQ87 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQ87 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQ87 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQ87 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQ87 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQ87 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQ87 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQ87 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQ87 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQ87 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U3KQ87 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQ87 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQ87 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQ87 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQ87 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQ87 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQ87 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQ87 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQ87 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQ87 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQ87 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQ87 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQ87 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQ87 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQ87 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQ87 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KQ87 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KQ87 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KQ87 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
U3KQ87 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQ87 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQ87 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQ87 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQ87 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQ87 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQ87 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQ87 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQ87 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQ87 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQ87 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQ87 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQ87 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQ87 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQ87 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQ87 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQ87 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQ87 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQ87 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQ87 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQ87 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQ87 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQ87 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQ87 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
U3KQ87 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQ87 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQ87 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQ87 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQ87 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQ87 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQ87 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQ87 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQ87 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQ87 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQ87 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQ87 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQ87 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQ87 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQ87 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQ87 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQ87 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQ87 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQ87 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KQ87 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KQ87 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KQ87 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQ87 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQ87 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQ87 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQ87 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQ87 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQ87 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQ87 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQ87 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQ87 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQ87 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQ87 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQ87 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms