Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R4GMQ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R4GMQ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R4GMQ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R4GMQ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
R4GMQ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R4GMQ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R4GMQ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R4GMQ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R4GMQ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R4GMQ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R4GMQ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R4GMQ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R4GMQ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R4GMQ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R4GMQ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
R4GMQ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R4GMQ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R4GMQ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R4GMQ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R4GMQ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R4GMQ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R4GMQ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R4GMQ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
R4GMQ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R4GMQ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R4GMQ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R4GMQ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R4GMQ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R4GMQ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R4GMQ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
R4GMQ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R4GMQ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R4GMQ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R4GMQ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R4GMQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R4GMQ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R4GMQ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R4GMQ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R4GMQ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R4GMQ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R4GMQ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R4GMQ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R4GMQ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R4GMQ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R4GMQ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R4GMQ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R4GMQ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R4GMQ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R4GMQ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R4GMQ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R4GMQ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R4GMQ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R4GMQ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R4GMQ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R4GMQ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R4GMQ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R4GMQ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R4GMQ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
R4GMQ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R4GMQ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R4GMQ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R4GMQ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R4GMQ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R4GMQ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R4GMQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R4GMQ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R4GMQ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R4GMQ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R4GMQ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R4GMQ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R4GMQ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R4GMQ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R4GMQ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R4GMQ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R4GMQ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R4GMQ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R4GMQ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R4GMQ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R4GMQ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R4GMQ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R4GMQ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R4GMQ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R4GMQ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R4GMQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R4GMQ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R4GMQ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R4GMQ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R4GMQ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R4GMQ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
R4GMQ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms