Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DYNC1LI1Q9Y6G9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1LI1Q9Y6G9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.9 ms