Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X9

LIPG, Endothelial lipase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPGQ9Y5X9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPGQ9Y5X9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIPGQ9Y5X9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPGQ9Y5X9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPGQ9Y5X9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIPGQ9Y5X9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIPGQ9Y5X9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPGQ9Y5X9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPGQ9Y5X9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPGQ9Y5X9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPGQ9Y5X9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPGQ9Y5X9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.8 ms