Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GTF3C3Q9Y5Q9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GTF3C3Q9Y5Q9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GTF3C3Q9Y5Q9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms