Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXBP1Q9Y5B6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PAXBP1Q9Y5B6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAXBP1Q9Y5B6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms