Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP12Q9Y561 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRP12Q9Y561 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP12Q9Y561 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP12Q9Y561 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms