Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB11Q9Y547 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB11Q9Y547 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB11Q9Y547 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB11Q9Y547 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms